Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 AC010183.1-201ENST00000552413 559 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 ATRAID-202ENST00000405489 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 AC233724.9-201ENST00000511694 407 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 AC092720.1-202ENST00000565824 555 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
DMDP11532 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 CRYZL1-205ENST00000399442 612 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 C3orf84-201ENST00000432035 669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 TPP1-209ENST00000528657 578 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 EDN1-201ENST00000379375 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 CYB5D2-202ENST00000573984 495 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
DMDP11532 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 CHRNA1-204ENST00000409323 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 YY1P2-201ENST00000438766 948 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 AC245100.4-201ENST00000634549 1082 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 RBFOX1-214ENST00000552089 1430 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
DMDP11532 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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