Protein–RNA interactions for Protein: O95398

RAPGEF3, Rap guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

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Length 923 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF3O95398 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 SMIM15-202ENST00000507416 584 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 AC097381.2-201ENST00000510640 859 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 RNASEK-204ENST00000552039 591 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 RN7SL524P-201ENST00000581152 300 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 HTD2-205ENST00000477305 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 IFITM1-201ENST00000328221 844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 AC112484.2-201ENST00000498297 1298 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RAPGEF3O95398 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC21.33■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 BLOC1S1-203ENST00000548925 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 AC113385.2-201ENST00000614465 762 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RAPGEF3O95398 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
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