Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
UPP2O95045 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
UPP2O95045 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UPP2O95045 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UPP2O95045 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UPP2O95045 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UPP2O95045 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UPP2O95045 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UPP2O95045 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
UPP2O95045 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
UPP2O95045 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UPP2O95045 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
UPP2O95045 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms