Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PPFIA3O75145 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PPFIA3O75145 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms