Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC15.05■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.05■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.05■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.05■□□□□ 0
VWA8A3KMH1 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VWA8A3KMH1 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms