Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 HARS2-201ENST00000230771 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms