Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2M0

FAN1, Fanconi-associated nuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAN1Q9Y2M0 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
FAN1Q9Y2M0 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.7 ms