Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 EBLN3P-202ENST00000625445 4520 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PPARGC1AQ9UBK2 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms