Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
TMPRSS4Q9NRS4 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms