Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ZNF286B-205ENST00000545289 5328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 KCNIP3-201ENST00000295225 2940 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 IRS1-201ENST00000305123 9705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
FANCFQ9NPI8 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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