Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
GABARAPL3Q9BY60 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms