Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 SIGLEC6-201ENST00000343300 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 TMC8-201ENST00000318430 4411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 NEK4-202ENST00000383721 2576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 CADM1-204ENST00000536727 3520 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RHOXF2Q9BQY4 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms