Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PMCHL2Q9BQD1 SHPRH-202ENST00000367503 5237 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PMCHL2Q9BQD1 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PMCHL2Q9BQD1 SLC4A2-204ENST00000461735 4387 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PMCHL2Q9BQD1 ZBTB20-211ENST00000471418 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PMCHL2Q9BQD1 KIF3A-208ENST00000618515 3333 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PMCHL2Q9BQD1 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PMCHL2Q9BQD1 PIP5K1A-204ENST00000409426 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PMCHL2Q9BQD1 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PMCHL2Q9BQD1 CEP68-201ENST00000260569 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PMCHL2Q9BQD1 DLGAP1-212ENST00000515196 5314 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PMCHL2Q9BQD1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 NBPF12-208ENST00000617931 7061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 FGFR1-207ENST00000397103 2953 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 ROBO1-212ENST00000618833 7492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 ACO2-201ENST00000216254 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 ARHGAP33-203ENST00000314737 3858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 SUPV3L1-201ENST00000359655 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 RRBP1-206ENST00000455029 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 PARP10-205ENST00000525773 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 FERMT2-202ENST00000343279 3247 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 PLEKHM1P1-202ENST00000578036 4318 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 AC244453.2-201ENST00000457996 3543 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 SH2D7-201ENST00000328828 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 HAS3-202ENST00000306560 4220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 MAGED1-201ENST00000326587 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 SNX22-201ENST00000325881 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 DGKZ-216ENST00000528615 2692 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 CMIP-208ENST00000566462 3512 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 DLGAP3-202ENST00000373347 3856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 GPRASP1-201ENST00000361600 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 NKAP-201ENST00000371410 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 CPT1C-204ENST00000405931 2785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 GRIN2A-206ENST00000562109 4338 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 POLD1-201ENST00000440232 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 CELSR3-201ENST00000164024 11956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 HADHB-209ENST00000545822 1870 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PMCHL2Q9BQD1 ZNF398-201ENST00000426851 5268 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms