Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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KCNS3Q9BQ31 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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KCNS3Q9BQ31 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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KCNS3Q9BQ31 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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KCNS3Q9BQ31 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
KCNS3Q9BQ31 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
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