Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RBBP8Q99708 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 PLIN4-202ENST00000633942 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
RBBP8Q99708 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms