Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 FXYD2-202ENST00000292079 571 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 KRTAP12-2-201ENST00000360770 739 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 HMGA1P2-201ENST00000430198 324 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 FGF21-202ENST00000593756 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 ZNF143-202ENST00000396597 1954 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AIG1-203ENST00000367596 559 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 THAP4-203ENST00000402545 833 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AP001615.1-201ENST00000423276 461 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 CTB-178M22.2-201ENST00000519795 503 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 FAM187B2P-201ENST00000577135 713 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 KRTAP10-4-202ENST00000616689 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 CBR3-AS1-210ENST00000623484 392 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 CBR3-AS1-215ENST00000624086 594 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 Z82244.2-201ENST00000632196 448 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 DDX19B-213ENST00000568625 1681 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ALPK3Q96L96 ATP5J-204ENST00000400093 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114 ms