Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 ELP4-201ENST00000350638 1907 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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GTF3C6Q969F1 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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GTF3C6Q969F1 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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GTF3C6Q969F1 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
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GTF3C6Q969F1 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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GTF3C6Q969F1 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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GTF3C6Q969F1 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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GTF3C6Q969F1 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GTF3C6Q969F1 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GTF3C6Q969F1 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms