Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SLC4A8-205ENST00000535225 2262 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 MANEAL-204ENST00000525897 1294 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
APTXQ7Z2E3 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms