Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 DRG2-220ENST00000583355 891 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CTXN3Q4LDR2 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms