Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 FDPSP7-201ENST00000429043 1054 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AC092295.1-201ENST00000446262 434 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AL136084.1-201ENST00000449172 318 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 RN7SL672P-201ENST00000474091 317 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 RPSAP70-201ENST00000504462 864 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 TBC1D3P6-201ENST00000505954 962 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 SHBG-217ENST00000576478 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 CBR3-AS1-207ENST00000608641 777 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AC006207.1-201ENST00000637958 562 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 TRPM3-205ENST00000361823 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AC007391.1-201ENST00000433893 504 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 DLGAP4-AS1-203ENST00000439595 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AL031587.2-201ENST00000445483 414 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 B9D1-206ENST00000461069 923 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AP003040.1-201ENST00000532044 1024 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AL080250.1-203ENST00000607799 747 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 AL499606.1-201ENST00000627866 413 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 RIBC1-202ENST00000375327 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 UBL7-206ENST00000565335 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
VPS72Q15906 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 LINC01864-201ENST00000587218 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 CAMP-201ENST00000296435 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 SAPCD1-AS1-202ENST00000419679 461 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 IFITM2-205ENST00000602569 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 Metazoa_SRP.128-201ENST00000620543 314 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 MIF4GD-201ENST00000245551 1358 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AP003031.2-205ENST00000531263 683 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 GRAMD4P6-201ENST00000556999 244 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VPS72Q15906 AC004584.1-201ENST00000572187 549 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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