Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TAF1AQ15573 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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TAF1AQ15573 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TAF1AQ15573 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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