Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SKIV2LQ15477 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 HLA-DMA-203ENST00000395305 777 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 ZNF879-202ENST00000519896 543 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 FXYD6-FXYD2-201ENST00000532984 670 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 C2-205ENST00000418949 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SKIV2LQ15477 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms