Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 NSD2-204ENST00000382891 7534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 BCL2L1-201ENST00000307677 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 ADCY4-202ENST00000418030 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 AC015819.3-201ENST00000624305 2674 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 GLIS3-202ENST00000381971 3961 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 SKA3-202ENST00000314759 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 NTRK2-203ENST00000323115 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 LRRC41-206ENST00000615587 2842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 TRIM69-206ENST00000559390 2486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 PER1-202ENST00000354903 3115 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 ABCB8-202ENST00000358849 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 ZNF519-206ENST00000589498 2117 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 CYTH1-203ENST00000585509 3315 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
NBR1Q14596 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms