Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 C1QTNF1-204ENST00000392445 2833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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FOXE3Q13461 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FOXE3Q13461 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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FOXE3Q13461 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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FOXE3Q13461 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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FOXE3Q13461 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FOXE3Q13461 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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