Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 DPY19L2P4-201ENST00000479881 442 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 CMTM1-219ENST00000533953 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AC009120.2-205ENST00000561921 490 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AC009041.4-201ENST00000620075 638 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AK6-202ENST00000380822 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 OR2T8-201ENST00000319968 939 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 CCL19-202ENST00000378800 414 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AC000077.1-201ENST00000420012 953 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 ISL1-203ENST00000511384 981 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AC026470.4-201ENST00000565812 308 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 SCAMP5-216ENST00000568081 710 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 OR2T8-202ENST00000641945 1226 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 S100B-201ENST00000291700 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 S100A2-202ENST00000368708 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 RN7SKP212-201ENST00000410851 328 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 TCEAL4-206ENST00000468024 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AC004889.1-201ENST00000498693 856 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AC022447.5-201ENST00000504817 392 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 GLIPR1L2-203ENST00000547164 509 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 IFNL3P1-201ENST00000595082 501 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 AC106782.5-201ENST00000616011 337 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NUP160Q12769 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP160Q12769 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP160Q12769 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP160Q12769 TLE3-203ENST00000451782 2356 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP160Q12769 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NUP160Q12769 DAO-208ENST00000551281 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP160Q12769 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP160Q12769 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP160Q12769 VASH2-205ENST00000366967 1206 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP160Q12769 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP160Q12769 MPV17-209ENST00000405983 859 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP160Q12769 RMDN1-218ENST00000523911 950 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP160Q12769 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP160Q12769 NAV2-AS2-201ENST00000533767 782 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP160Q12769 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP160Q12769 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP160Q12769 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP160Q12769 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP160Q12769 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP160Q12769 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP160Q12769 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP160Q12769 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP160Q12769 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NUP160Q12769 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms