Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 AC009065.6-201ENST00000568795 456 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 NIFK-AS1-203ENST00000419902 1316 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 SERBP1P2-201ENST00000436888 1164 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ABCC8Q09428 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms