Protein–RNA interactions for Protein: Q08554

DSC1, Desmocollin-1, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC1Q08554 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
DSC1Q08554 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms