Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AC010326.4-201ENST00000604665 891 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PDE4DQ08499 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms