Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 MRPL55-205ENST00000366731 1423 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 KCTD18-202ENST00000409157 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
PSME1Q06323 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms