Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 MLLT11-201ENST00000368921 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
CHRNEQ04844 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms