Protein–RNA interactions for Protein: Q02539

HIST1H1A, Histone H1.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H1AQ02539 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 MEST-204ENST00000393187 2380 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 WIZ-202ENST00000389282 4067 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 COG6-202ENST00000416691 5257 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 AC073957.3-201ENST00000609998 6758 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 KARS-201ENST00000302445 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 UNC13B-202ENST00000378496 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 FAM168B-202ENST00000409185 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 Z83844.1-201ENST00000455236 4904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
HIST1H1AQ02539 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms