Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ARPIN-201ENST00000357484 7591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 RAB11FIP1-202ENST00000330843 7811 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 STK38L-201ENST00000389032 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 TP53INP1-202ENST00000448464 5631 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 TIAM1-201ENST00000286827 7200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ARGLU1-203ENST00000400198 3390 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 AC106818.1-201ENST00000623223 3242 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
HERVK_113P63121 CCT8L2-201ENST00000359963 2060 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms