Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 IRF9-202ENST00000396864 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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FDFT1P37268 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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FDFT1P37268 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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FDFT1P37268 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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FDFT1P37268 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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FDFT1P37268 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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FDFT1P37268 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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FDFT1P37268 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
FDFT1P37268 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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