Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 MYL3-202ENST00000395869 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
HOXC13P31276 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms