Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYT1P21579 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 SLC37A4-216ENST00000538950 2032 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYT1P21579 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYT1P21579 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms