Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 LINC02537-201ENST00000635943 1367 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 FANCA-205ENST00000543736 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
EPCAMP16422 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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