Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 BX679664.3-201ENST00000414070 555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC113935.1-201ENST00000471722 555 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXD8P13378 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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