Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ZNF646-202ENST00000394979 8118 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 EIF5-202ENST00000392715 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 ITGB3-201ENST00000559488 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 UBASH3A-203ENST00000398367 1733 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
VPREB1P12018 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms