Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 GPM6B-210ENST00000493677 1372 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AL121895.1-202ENST00000441208 2701 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 PDXK-210ENST00000468090 7297 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 SAMMSON-206ENST00000641053 1516 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 TMEM126B-201ENST00000358867 989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 PPCS-204ENST00000372562 966 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 FAM53B-AS1-201ENST00000432699 558 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC134698.1-201ENST00000511619 643 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 RDH10-203ENST00000519380 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 KHDRBS3-206ENST00000520981 1243 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC090589.2-201ENST00000532022 332 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC009654.1-201ENST00000560503 757 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC115989.1-201ENST00000574288 491 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC010320.5-201ENST00000619124 676 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 LINC01173-201ENST00000629370 331 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ATXN8OSP0DMR3 AL160274.1-201ENST00000623623 1515 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms