Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PTPRCP08575 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PTPRCP08575 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
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