Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CYBBP04839 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 TAF8-202ENST00000372978 794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CYBBP04839 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CYBBP04839 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms