Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALUO43852 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALUO43852 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CALUO43852 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALUO43852 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALUO43852 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALUO43852 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALUO43852 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALUO43852 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALUO43852 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALUO43852 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALUO43852 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CALUO43852 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CALUO43852 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALUO43852 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALUO43852 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALUO43852 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALUO43852 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALUO43852 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALUO43852 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALUO43852 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALUO43852 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALUO43852 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALUO43852 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALUO43852 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALUO43852 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALUO43852 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALUO43852 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CALUO43852 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALUO43852 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALUO43852 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALUO43852 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALUO43852 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALUO43852 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALUO43852 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALUO43852 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALUO43852 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALUO43852 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALUO43852 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALUO43852 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALUO43852 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALUO43852 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALUO43852 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALUO43852 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CALUO43852 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms