Protein–RNA interactions for Protein: A6PVL3

KNCN, Kinocilin, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNCNA6PVL3 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 PIK3R5-219ENST00000616147 4377 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
KNCNA6PVL3 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms