Protein–RNA interactions for Protein: A4D1U4

LCHN, Protein LCHN, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCHNA4D1U4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LCHNA4D1U4 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LCHNA4D1U4 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms