Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 STOX2-201ENST00000308497 10458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 FBN3-201ENST00000270509 9232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 PITPNM3-202ENST00000421306 6945 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 MYBBP1A-201ENST00000254718 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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ARL2-SNX15V9GYD0 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 CEP78-205ENST00000424347 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
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ARL2-SNX15V9GYD0 ABCA3-201ENST00000301732 6609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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ARL2-SNX15V9GYD0 LRRC15-201ENST00000347624 5883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 CDC45-205ENST00000437685 2072 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 NUMA1-205ENST00000393695 7343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 NUMA1-234ENST00000620566 7012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 DMBT1-201ENST00000330163 5802 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 DMBT1-206ENST00000368956 5802 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ARL2-SNX15V9GYD0 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
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