Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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SH3BP1Q9Y3L3 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
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SH3BP1Q9Y3L3 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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SH3BP1Q9Y3L3 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SH3BP1Q9Y3L3 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SH3BP1Q9Y3L3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SH3BP1Q9Y3L3 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SH3BP1Q9Y3L3 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SH3BP1Q9Y3L3 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SH3BP1Q9Y3L3 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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