Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AC131212.3-201ENST00000624087 4219 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
CGGBP1Q9UFW8 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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