Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 AC010186.1-201ENST00000546259 532 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MBD5Q9P267 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MBD5Q9P267 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MBD5Q9P267 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MBD5Q9P267 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MBD5Q9P267 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MBD5Q9P267 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MBD5Q9P267 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MBD5Q9P267 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MBD5Q9P267 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
MBD5Q9P267 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 KCNE1-203ENST00000399286 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 TPRKB-203ENST00000409716 816 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 IMMP1L-202ENST00000526776 469 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 F11R-204ENST00000537746 1245 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MBD5Q9P267 RRAGA-201ENST00000380527 1589 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MBD5Q9P267 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MBD5Q9P267 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms