Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 KLHL9-201ENST00000359039 5710 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 SPATS2-223ENST00000553127 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TRIM5Q9C035 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms