Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 GTF2IP13-202ENST00000609439 10247 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM246-202ENST00000374848 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHM1P1-205ENST00000582986 5014 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CELF2-216ENST00000637215 2724 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 HECW1-201ENST00000395891 9501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 FLT4-212ENST00000619105 3806 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AKNA-201ENST00000223791 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 LRRC8A-201ENST00000259324 4619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 TIAM1-206ENST00000541036 7018 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 SIRT2-201ENST00000249396 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 TACC2-209ENST00000369004 3667 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 SIRT2-204ENST00000392081 2062 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 ALKBH5-201ENST00000399138 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PDE4A-204ENST00000440014 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC7A8-205ENST00000453702 1752 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
MAP1LC3CQ9BXW4 RB1-201ENST00000267163 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 TCF3-220ENST00000611869 4409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 DNMT3B-203ENST00000348286 4048 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PRRC2A-202ENST00000376033 6893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC10.71□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 DNAH10OS-201ENST00000514254 5040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 BCL2L1-202ENST00000376055 2383 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 OTOG-202ENST00000399391 8778 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 IP6K1-202ENST00000395238 4117 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 KCNQ3-201ENST00000388996 11510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 SHROOM3-201ENST00000296043 11020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF106-205ENST00000565611 5081 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CIT-203ENST00000392521 8708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AC012531.1-201ENST00000562848 2680 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 EBF1-201ENST00000313708 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 RNFT2-201ENST00000257575 3882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
MAP1LC3CQ9BXW4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms